Acabo de encontrar en la red una aplicación del estilo de google desktop pero open source y que funciona tanto en windows como en Linux. Se llama Beagle y esta programada en C# usando GTK# yMono.

Entre los documentos que indexa para realizar las búsquedas, están los de Microsoft Word, Power Point, Open Office, pdf, rtf, ogg, mp3, jpg, png, txt, o códigos fuente python, java o c, por ejemplo.

Para más información:
http://www.gnome.org/projects/beagle/